抗战期间，国民政府迁都重庆后，此楼成为蒋介石总统重要的寓居和办公场所。在此曾经召开许多重要的军事、政治会议，因此，也成为当时军政要务的重要决策地之一。临窗远眺，既可欣赏群峰争秀，又可洞察山上山下来往的行人。顶楼设有岗哨，楼下建有防空洞，主楼之侧有一木柱穿透平房，面积17平方米，是蒋介石总统常去做礼拜的基督教礼拜堂。底楼为会议室的休息室，是蒋介石总统与军政要员研商军政机密的地方。楼前一峰独秀，原建有一小亭，名曰望江亭。当年蒋介石总统常在亭内观看山景，欣赏两江景色。而今,陈列馆在别墅二楼卧室、办公室、会客室里，分别展出了蒋介石总统在黄山工作、生活的历史图片和重要文稿等文史资料。
云岫楼1992年4月7日，重庆市人民政府公布为市级文物保护单位。
