人物履历
1970年毕业于台湾省清华大学化学系。
1971年至1977年赴美国留学，1976年获美国奥克拉荷马大学化学博士学位，曾参加“保卫钓鱼台运动”和“中国统一运动”。
1977年至1995年任中国科学院化学研究所副研究员、研究员、博士生导师，兼台湾省同学会会长，中国物理学会光散射专业委员会副主任（其间，1980年至1983年为美国纽约大学博士后、美国科罗拉多州大学化学系研究员；1989年至1990年为香港浸会学院访问教授。1999年1-6月，台湾省中央大学物理系访问讲学）。
1995年至今任清华大学物理系教授。
1995-1997年任中华全国台湾省同胞联谊会副会长。
1997年11月至2017年12月任台盟中央副主席。
担任职务
第五、六、七、八届全国人大代表。第九、十届、十一届全国政协常委，十一届全国政协港澳台侨委员会副主任委员。第三届台盟总部常务理事，四届台盟中央主席团委员，五届台盟中央常委，六、七、八、九届台盟中央副主席，十三届全国政协委员、常委。
研究领域
拉曼峰强研究包括1.表面增强拉曼光谱学（1985－1987,2002-2004国家基金委资助）。拉曼峰强则隐含着分子中电子与核的运动相互作用的诸多信息。拉曼谱学界仍鲜有重视从拉曼峰强入手来研究分子结构信息的。表面增强拉曼谱是分子吸附在金，银和一些过渡金属粗糙表面(包括电极,胶体表面,它们的本质是纳米颗粒)后拉曼峰强极度增强的现象，因此它是良好的从拉曼峰强角度研究的对象。
2.极稀微掺杂分子晶体相变拉曼峰强的研究（1997－1999国家基金委资助）。
拉曼方法是研究分子结构的有效手段。拉曼谱峰的频率反映分子中化学键的强度,而拉曼峰强则隐含着分子中电子与核的运动相互作用的诸多信息.拉曼谱学界仍鲜有重视从拉曼峰强入手来研究分子结构信息的。
研究项目运用李代数方法来研究分子高激发振动态的结构。总体思路主要在避开解薛丁谔方程的複杂问题，同时结合实验的结果，半经典地处理複杂的高激发振动态，突出其物理图象以及对称性及其破缺等现象。
3.分子高激发振动态〔1995－1997，2000－2002，2004-2006国家基金委资助〕。
在分子振动的陪集空间表示中，轨迹体现着振动的非线性，混沌动力学行为。本项目主要从轨迹的性质如其周期性，李雅普诺夫指数了解高激发态的动力学性质，运动的模式（如是否具有遍历性，局域性），是否具有（近似的）守恆量，以及这些守恆量，或它们的破缺，与本徵係数（波函式），相空间中的密度，轨迹的混沌程度的关係。总之，本项目着重研究了在分子高激发振动体系中量子力学中的各种概念（如量子数，量子态），在经典近似下与非线性力学中的各种概念的内在关联。同时，我们将特别着重探讨周期、混沌轨迹的性质以及它们与不可积体系的量子化问题的关联特性等。
相关荣誉
吴国祯主持仪式获1994年中国科学院自然科学二等奖（表面增强拉曼光谱学研究工作）。 中国物理学会光散射专业委员会委员,(1987-2001任副主任)。
光散射学报编委(1995-2001任主编)。
《中国物理快报》特邀评审，《化学物理》编委。
清华大学物理系学术委员会主任（1998-2000）。
学位委员会委员（2004-）。
校学术委员会委员（1998-2003）。
主要着作
1.吴国祯《分子振动光谱学基础》，化工出版社，1990年。
2.吴国祯《分子振动光谱学概论：原理与研究》，2001年，台湾省高立出版社.北京华夏英才基金资助由清华大学出版社出版(2001年)。
3. 《分子振动的混沌理论》，科学出版社出版（2003）。
4.《NonlinearityandchaosinMolecularvibrations》，Elsevier,2005。
5.《拉曼谱学：峰强中的信息》国家科学技术学术着作出版基金资助，
科学出版社出版（2007）。
（1）专着：《分子振动光谱学基础》，化工出版社1990年。
（2）发表论文六十余篇，其中三十余篇在国际期刊上发表。
（3）有关表面增强拉曼谱学的工作获1994年中国科学院自然科学二等奖。
