名词详解
融合次元“学园”的领导者“教授”赤马零王为了统一4次元而实行“ARC领域计画”，派出“学园”培养的学生作为战士来到超量次元，对其城市进行破坏，并对超量次元的居民（不管会不会打牌）无差别地封印进卡片。为了反抗“学园”对超量次元居民的狩猎，超量次元“心园”的决斗者组成“抵抗运动”。“抵抗运动”内部根据“决斗学校”而划分，如黑桃校（スペード校）、梅学校（クローバー校，在英国梅花“クラブ”被理解为四叶草“クローバー”）等。“抵抗运动”成员身上的某处都缠绕着红色方巾作为标誌（例如游斗的手肩上、黑咲隼的脖子上、快斗的右手）。拥有的特殊决斗盘会在决斗时会令战斗伤害实体化，有当打败敌人时可以将对方变成卡片特殊功能（黑咲隼的决斗盘因被赤马零儿改造，失去了将对手变成卡片的特殊功能）。
成员黑咲隼为了寻回被神秘人（游里）掳走的妹妹黑咲琉璃，得知赤马零王的儿子是基础次元的LDS社长赤马零儿后，黑咲隼穿越次元来到基础次元而不断袭击LDS的决斗者，试图引出赤马零儿并将其绑架作为人质来跟赤马零王换回妹妹。黑咲隼的好友游斗追着隼也来到了基础次元。游斗在跟同调次元决斗者游吾的决斗中落败并跟榊游矢合一。黑咲隼则加入了有赤马零儿组织的对抗“学园”的小队——枪兵团。
黑咲隼和游斗离开心园后，他们所在的黑桃学校成员全部覆灭，其他决斗学园分部也遭受一定程度的打击。梅花学校的残余成员找到了决斗庵作为基地，而快斗的家人则全部被变成卡片。愤怒的快斗脱离大伙独自一人对付着“学园”军。
集团成员
黑桃学校
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| 游斗（ユート/Ute）声优：高木万平卡组：幻影骑士团王牌：暗叛逆XYZ龙（☆4）、暗镇魂XYZ龙（☆5）和游矢面貌相似，为夺回黑咲被抢的妹妹琉璃以「学园」为目标找上了LDS。在与游吾的决斗中败北和游矢合为一体陷入沉睡，在游矢经历第一次四龙共鸣后再度甦醒，从此和游矢形影不离。 | |
黑咲隼（Kurosaki Shun）声优：金城大和卡组：RR（急袭猛禽）王牌：急袭猛禽-起翼猎鹰（☆4）升阶：急袭猛禽-革命猎鹰（☆6）、急袭猛禽-卫星加农猎鹰（☆8）、急袭猛禽-究极猎鹰（☆10）为找回被夺走的妹妹琉璃从超量次元来到舞网市。接受赤马零儿提出的联手对付赤马零王的提议并加入枪兵团。和游斗既是来自同一故乡共同奋斗的伙伴，也是同一决斗学院的同学。好不容易与妹妹重逢遭到异变的琉璃袭击，虽然战胜了琉璃却并未解除洗脑，在準备动身寻找控制琉璃的幕后黑手时被洗脑的塞瑞娜电击击倒 | |
黑咲琉璃（Kurosaki Ruri）声优：逢沢凛卡组：叙情歌鸲（Lynical Luscinia）王牌：叙情歌鸲-独立夜莺（★1）、叙情歌鸲-群聚夜莺（☆1）和柚子面貌相似，黑咲隼的妹妹，游斗的心上人。被游里抓到了融合次元“学园”，经过虫博士的洗脑控制成为主角方的敌人。 |
梅花学校
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| 天城快斗（カイト）声优：内山昂辉卡组：光波卡组王牌：银河眼光波龙（☆8）、超银河眼光波龙（☆9）“心园”决斗王的候补者，跟就读别校的黑咲隼之间处于竞争对手关係。出于家人和同伴被“学园”卡片化的愤怒，为了毁灭学园军而一个人战斗着。与黑咲的决斗后找回了本心，目前在融合次元为了打倒洗脑了琉璃的神秘人而奔走。 | |
神月亚莲（神月アレン）声优：村瀬迪与卡组：列车卡组王牌怪兽：重装甲列车 铁狼号（☆4）十分积极的家伙，很容易跟别人相处。虽然很乐于有游矢等人一起对抗学园，但在内部问题上排斥游矢等人。在与金银姐妹的决斗中败北被游矢等人救下，从此真心接受游矢并在游矢前往融合次元时，赠给了自己的滑轮鞋。 | |
笹山沙耶加（笹山サヤカ）声优：前川凉子卡组：妖精（フェアリー）卡组王牌怪兽：妖精啦啦队少女（☆4）黑咲琉璃的好友，性格有点内向。在快斗去融合次元时将小妖精赠与快斗。 |
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