深澳坑溪流向于深澳国小之前溪段位于深澳坑路的左边、过路面桥(而路面桥之前往右即朝福美寮方向)即国小前和之后则溪段位于深澳坑路的右边。后沿路流经三坑、五坑、六坑,于新北市瑞芳区瑞芳车站附近的台铁深澳线和宜兰县铁路交点分叉处、即相思岭下注入基隆河。基本上深澳坑溪从贡仔寮开始一路顺着深澳坑路地势由高向低流向瑞芳,且和鱼桀鱼坑溪对向一北一南注入基隆河。
深澳坑溪(Shen-Ao Keng Creek)发源于台湾省基隆市信义区月眉山(220m)东北侧"天外天环保公园"附近,流经贡仔寮、基隆市第2公墓、万源、基隆市第3公墓,后流经"深澳坑派出所"后面、接着流经深澳国小(远处即已废坑的深澳坑煤矿和福美寮一坑煤矿、福美寮二坑煤矿)前面。