地理环境
地理位置
黄岩岛位于北纬15°13′48″至15°05′24″，东经117°40′12″至117°52′00″；距菲律宾吕宋岛西岸约230公裏，距广州约1112公裏。是由狭长大半园形的珊瑚带围成的，平潮时几乎淹没的环礁。
地形地貌
黄岩岛是周边数十万平方公裏海域内唯一露出水面的礁盘，战略地位十分重要。
黄岩岛而且周长约50公裏，礁盘面积巨大，达到 139平方公裏，超过了南沙任何一个单独的礁盘，为南沙美济礁面积的3倍，可以说中沙黄岩岛是“少而精”的岛礁。黄岩岛整个礁盘浅水区（水深1米左右）面积广阔，开发建设十分方便。礁盘口门宽大，经过疏浚深挖建设后可以进出大型舰艇。由于有一圈完整的环礁阻挡，礁盘外风浪无法进入潟湖，一直是渔船的避风良港。
从上俯瞰，黄岩岛是一个巨大却不标準的“C”字图案。一条椭圆形的礁盘与珊瑚礁群长度约55公裏，把一个95平方公裏大小的澙湖包含其中。礁石露出海面的高度一般在0.5至3米，表面大小一般为1至4平方米。以北、南两端的礁块最为密集，北端者称为北岩，南端者称为南岩。南岩是在礁盘上露出海面的巨大的礁石之一，形似大石柱，上部面积约3平方米，海拔1.8米。退潮时，站在澙湖口，最多可以看见上百块礁石露出水面，它们多以土黄颜色为主，偶有黑色。站在岛上环顾四周，礁盘许多地方水深仅一、两米，形似浅滩。从海底仰视看，黄岩岛却是一座陡峭的高山。
只要离开礁盘十公裏，就是3000米的深海。
黄岩岛以东是幽深的马尼拉海沟，这是中国中沙群岛与菲律宾群岛的自然地理分界。黄岩岛四周为距水面0.5米到3米之间的环形礁盘，礁盘周缘长55公裏，面积139平方公裏，礁盘外形呈等腰直角三角形，其内部形成一个面积为95平方公裏、水深为10-20米的潟湖。黄岩岛发育在3500米深的海盆上，是南海中沙群岛中唯一露出水面的岛屿，四周为距水面半米到3米之间的环形礁盘。东南端有一个宽400米的通道与外海相连，水深9~11米，宽360~400米，中型渔船和小型舰艇可由此进入，是极好的渔场和避风之处。
防图片误认：有的人把黄岩岛误认为西太平洋岛国密克罗尼西亚的（有山有树的）帕金环礁。有的人说”黄岩岛本有植被而后来被破坏了“，其实混同了两个岛礁。
气候水温
两个佳期：每年四、五月和十、十一月，风平浪静的海水，清澈、浅蓝、透明。
气候：南海诸岛四季如夏，温暖湿润，干湿季分明，雨期集中，雨量充沛，且受季风影响，属于典型的热带海洋性季风气候类型。 黄岩岛的气候应该比三亚稍热，和马尼拉差不多；它处在三千多米的深海之上，绝对海洋性气候；会比马尼拉更好些。
海流：黄岩岛附近的海流，随季风而变化；东北季风时，以西北和西流为主；西南季风时为东北流。
水温：三沙海域受大陆气候和陆地逕流影响很小，深海盆地水体深厚、盐度较高、透明度大、水温季节变化较小。海流夏天流向东北，冬天流向西南，流速0.1～1.0海裏/小时。海浪全年平均有效波高1～2米，最大有效波高7.5～9.5米，居中国四大陆缘海之首。海面平均水温24～30℃之间，南北海水温差和海水年温差约2～5℃，且温差变化自北向南减小；但海水表层与底层（水深500米以下）温差却很大，可相差20℃之多。海水含盐度在32‰～35‰之间。海水透明度在20～30米之间，高于中国另外3个海域的透明度。
地质构造
南海盆地在漫长的地质活动过程中，形成一系列东北-西南走向的隆起高地和深邃海槽相间排列的海底地貌，自外围至中心顺次为大陆架、大陆坡、中央海盆，呈近似同心圆式的3层环状结构。
海底地貌的总特点是：北、西、南部是浅海大陆架，外缘是大陆坡，陆坡上有高原、海山、峡谷、海槽和海沟；东部是狭窄的岛架，外缘临海沟和海槽；中央是深水海盆，盆底为宽广的平原，点缀着孤立的海山。整个南海海底地貌可分为北部堆积型陆架区、北部断裂阶坡区、西部堆积-侵蚀型陆架区、西部断裂阶坡区、南部堆积型大陆架区、南部分割高原陆架区、东部侵蚀-堆积型岛架区、东部断裂沟脊岛坡区和中央深海平原区等9个地貌区划，地貌类型均属珊瑚礁地貌。
从地质构造上看，黄岩岛是中国大陆架的自然延伸。黄岩岛以东有幽深的马尼拉海沟，海沟最深处水深5377米，是南海水深最深的地区之一。黄岩岛是在涨潮时高于水面、自然形成的陆地区域，而不是终年隐藏于水底的沙洲或暗礁。从地质构造上看，黄岩岛是中国大陆架的自然延伸，而不是一个游离的海岛。
海洋资源
黄岩岛附近海区，有十分丰富的渔类资源和矿产资源，是良好的天然渔场，有大量的优质石斑鱼、鳗鱼、海鲤、鹦鹉鱼、鲨鱼、海豚、鸡尾鱼等；还有丰富的贝类和藻类资源。黄岩岛海区蕴藏着极其丰富的矿产资源；主要是锰结核和金属软泥，所含的金属有30多种，其中锰、铜、钴、镍的含量最为丰富；另外石油和天然气也极丰富。随着陆上资源的日益减少，海洋资源的勘探和开发，越来越成为必须。
战略地位
南海渔业
黄岩岛是整个中沙群岛一带海域中，唯一一个有礁石露出水面的岛礁。
它的地理位置，对于中国神圣领土的完整性，对于开发南海的经济，其重要性不言而喻。
黄岩岛的地理位置十分特殊。对于每年4月至5月和10月至11月在南海进行渔业作业的中国渔民来讲，黄岩岛是深海渔业捕捞的重要渔场和热带风暴降临时的天然避风良港。
黄岩岛对中国深海渔业未来规划有非常重要意义。中国南海渔业捕捞集中于3大渔场，即北部湾大陆架渔场、大陆架渔场、西沙渔场。其中，前两个渔场开发的潜力已明显下降，渔业资源结构出现退化，已经开始控製捕捞作业规模。西沙渔场的开发潜力充沛却部分位于中越争议海域，中国渔民的捕捞作业面临着与黄岩岛同样的困境。这意味着中国渔业已经走向转型的关键时期，如果不进一步开拓南海传统海疆线，发展远洋渔业，中国渔业走向萎缩已成必然之局。因此，黄岩岛对峙的背后其实关乎中国渔业资本的整体走向。
菲律宾在经济价值相对较弱的黄岩岛与中国争执，既有事先低估中国决心的因素在内，也不乏在次要问题上与中国争议进而模糊双方争议焦点的考虑在内。
海权竞争
美国为实现其在亚洲的战略利益，遏製中国的发展壮大，极力製造“中国威胁论”，并在南沙群岛领土争端中日益明显地站在某些国家的立场上。美国鼓吹“中国威胁论”，菲律宾在黄岩岛问题与中国针锋相对，为“中国威胁论”製造口实。几次主权争端后，黄岩岛在国际舆论中佔有一定地位，南沙问题成为国际关注的焦点。菲律宾在黄岩岛问题上的语气和态度因而变得越来越强硬，已明确表示不愿与中国举行有关领土纠纷的双边会谈，并积极筹划在东盟会议上邀请中国讨论黄岩岛和南沙问题。
菲律宾通过抓捕渔民会得到现实的经济利益。多数状告中国渔民“非法入境”“非法捕捞”的案子在经过与有关方面讨价还价，并交纳相当数量的罚款后，菲律宾当局便将渔民释放。这种现象几乎成了规律。另一方面，对于菲一些下层实权官员，如海军地区司令、地方警察官员来说，抓捕中国渔民就多了立功受奖的机会。
《国海洋法公约》有关200海裏专属经济区规定的出台后为菲侵佔黄岩岛找到了“理由”。菲律宾简单把距离远近作为其侵犯中国领土的依据。根据海洋法公约，沿海国在专属经济区内享有勘探或开发自然资源的权利，但专属经济区内它国领土的法律地位不容质疑。而中国黄岩岛本身也享有12海裏领海和12海裏毗邻区，菲律宾的专属区不应损害黄岩岛的领海和毗邻区，不应该以专属区的借口侵吞黄岩岛。黄岩岛与菲律宾群岛的地位是一致的，是平等的，都是领土，都享有领海和毗邻区。菲方的主张和行为与海洋法公约的準则背道而驰。专属经济区的开发利用与海洋管辖权是截然不同的两个问题，菲方有意将两者混为一谈。
中国主权
大陆介绍六铁证
2012年5月10日,《解放军报》10日发表题为《六大铁证：黄岩岛属于中国》 的文章指出， 自古以来，中国就拥有对黄岩岛的领土主权，这是有着充分的历史和法理依据的。菲律宾不断地玩弄各种小把戏、抛出各种自相矛盾的说法，实际上是心虚的表现。
根据国际通行準则，判断和证明一个国家对一片领土是否拥有主权主要基于两个方面，即历史依据和法理依据，二者之间的关系密不可分。涉及领土主权的国际法规有许多，这些国际法原则和规则的运用要以历史事实作为证据，而历史依据是否具有法律效力，则需要以这些国际法原则和规则为标準来判断和衡量。
铁证一：中国最早发现黄岩岛
在中国的大量历史文献中可以发现，早在2000多年前，中国人民就首先发现包括黄岩岛在内的南海诸岛及其海域，并首先予以命名，称之为“涨海”“涨海崎头”。（特别是）从宋代开始至明清时期，把南海诸岛命名为“石塘”“长沙”，其中包括黄岩岛在内的中沙群岛就在这个範围之内。
中国社会科学院中国边疆史地研究中心副主任李国强告诉记者，元朝时期，为了统一全国历法，元世祖敕令时任都水监、天文学家郭守敬主持开展实地测量，此即“四海测验”。1279年，郭守敬进行“四海测验”时，选定的27个纬度测量点之一就有黄岩岛。而这一事实，在中国历史文献中有着清晰的记载。
铁证二：中国对黄岩岛进行了长期的开发利用
黄岩岛海域是我国渔民的传统捕鱼场所，自古以来，我国渔船经常赴黄岩岛海域进行渔业生产活动，渔民还在岛上修建了码头等设施。中国政府多次派科学考察队到黄岩岛进行考察。1977年10月，中国科学院南海海洋研究所人员登上黄岩岛考察。1978年6月，该所人员再次赴黄岩岛进行考察。1985年4月由国家海洋局南海分局组织的综合考察队登上黄岩岛实施综合考察。1994年，我南海科学考察队抵达黄岩岛进行考察，并在岛上建立了1块1米高的水泥纪念碑。
铁证三：中国最早将黄岩岛列入版图、实施主权管辖
从法律层面上看，中国对黄岩岛拥有主权的一个重要依据是对该岛长期行使着有效管辖。作为官方行为，元朝时期的“四海测验”就体现了这一点，而类似的例子举不胜举。
北京大学海洋研究中心副主任李红云在接受记者採访时说，首先，中国政府曾于1935年、1947年和1983年三次正式公布黄岩岛的名称。其次，中国历代政府出版的官方地图均将黄岩岛标为中国领土。第三，在行政管辖方面，黄岩岛一直不间断地在中国广东省、海南省的管辖之下。黄岩岛由海南省西沙群岛、南沙群岛、中沙群岛办事处（现海南省三沙市）实施行政管辖。第四，从20世纪70年代起，中国政府受理并批準了多次国际无线电爱好者要求登岛探险的申请。
“批準申请和行政管辖行为完全是官方的、政府的行为，这是证明中国行使管辖权的直接证据。”李红云说。
铁证四：一系列国际条约规定，黄岩岛不在菲境内
因为历史特殊，所以菲律宾的领土範围是由一系列国际条约确定的。中国国家海洋局海洋发展战略研究所副所长张海文在接受採访时表示，包括1898年《美西巴黎条约》、1900年《美西华盛顿补充条约》和1930年《英美协定》等，这些条约明确地界定了菲律宾领土的西部界限在东经118°。黄岩岛位于东经117°51′，根本不在上述条约界限範围内。此外，1947年美菲一般关系条约、1952年菲美共同防御条约、1961年菲律宾关于领海基线第3046号法令和1968年菲律宾关于领海基线的修正令等，都反复地重申了上述条约的法律效力，确认菲律宾的领土範围，却从来都不包括黄岩岛。
铁证五：长期以来菲律宾官方地图从未包括黄岩岛
“在相当长的时期内，菲律宾的若干法律档案、官方档案和国家地图中，从未涉及黄岩岛。”李国强在接受採访时说，在1935年颁布的菲律宾宪法等菲国内法律法规中，菲官方屡次明文确认菲律宾领土範围，黄岩岛不仅不在其宣布的领土範围之内，而且菲律宾领海基点和基线也未涉及黄岩岛。1981年、1984年菲律宾出版的地图仍然将黄岩岛标绘在菲领土範围之外。1997年以前，菲律宾从未对中国政府对黄岩岛行使主权管辖提出过任何抗告，并且还多次表示黄岩岛在菲领土範围之外。
在1994年10月18日菲国家地图和资源信息部及1994年11月18日业余无线电协会向美国业余无线电协会出具的档案中，均确认“菲领土边界和主权是由1898年12月10日《巴黎条约》第三款所规定，黄岩岛位于菲领土边界之外”。
铁证六：菲律宾领土要求毫无法律依据
菲律宾方面曾经提出，黄岩岛在其主张的200海裏专属经济区内，因此是菲律宾的“固有领土”。对此，李红云表示，国际法上一项基本的规则从来都是“依据陆地统治海洋”，即国家先有了某陆地的主权，才能对邻接该陆地的海洋主张权利，而这一点在《联合国海洋法公约》当中已经得到了明确体现。菲律宾的主张恰恰相反，先主张对海洋的权利，再据此主张对该海域内陆地的权利。这显然是本末倒置。
二十一世纪以来，菲律宾又以对黄岩岛实行了管辖权为由，提出对黄岩岛拥有主权。菲律宾还特别提及了被视为经典的帕尔玛斯岛仲裁案。该案裁决通过缜密的推理所阐释的国际法规则是：国家通过对某土地长期地、有效地行使管辖权，即取得对该地的领土主权。李红云说，关于这一点，我们没有抗告。正是由于中国对黄岩岛行使了“长期、有效”的管辖权，中国才拥有了对黄岩岛的主权。
另外，菲律宾以“地理邻近”为借口提出领土要求在国际法上根本就不成立。国际法和国际实践早已认定“地理邻近”不是解决领土归属的国际法原则。世界上一个国家的部分领土距离本国较远而离其他国家更近的情况比比皆是。如果按照菲律宾的“地理邻近”论行事，天下岂不大乱。
台湾省补充两铁证
台湾省中菲关系学领域着名学者萧曦清的着作内容，对大陆官方2012年的说法补充了另外的铁证，其实包括两点：美国长期承认黄岩岛的中国主权；蒋介石政权曾长期管辖黄岩岛的主权。。
美国长期认中国主权
大陆官方文章的作者当时不了解一些信息，以致不了解有的极重要铁证。
菲律宾声明：20世纪50年代初（有的报道如此说是70年代初），驻菲苏比克湾的美国军队将黄岩岛开闢成为靶场；1957年，菲律宾政府和美国海军一起对该地区的海洋进行了调查，当时该地区实际受美国海军基地苏比克湾的控製。（辨别：有的文章说是50年代初，其实应该是70年代初的事，因为美军调查黄岩岛是1957-1958年，后来才有靶场现象）
真相如何呢？美国使用黄岩岛为靶场并不证明中国无主权（无论美国海军是否向台湾省当局申请过），而且，所谓“1957年菲律宾政府和美国海军一起对该地区的海洋进行了调查”，该事的真相是：美国海军曾申请并得到残余的中华民国政府批準，菲律宾政府只是协助美国海军搞调查。
附录：萧曦清着作相关内容——文章“美国承认黄岩岛是中国领土” 有介绍（网上有一些转载）：
萧曦清《南沙风云》在2011年获得台湾省的华侨救国团联合总会「学术论着项社会人文科学类」首奖。《南沙风云》第一七七页书曰：「美国海军向中华民国申请，经中华民国政府核準后，派遣地质勘察人员自一九五七年二月至一九五八年二月赴南沙群岛的北子礁及中沙群岛的民主礁进行地质勘察。」
萧曦清《中菲外交关系史》和英文版的《南沙争议》也都记载过，美国海军派遣人员要到这两个岛上去进行地质勘察，事先向「中华民国」申请。这无疑是表示美国承认了北子礁（即北子岛）和民主礁（即黄岩岛）的主权属于中国。既然美国曾事先向「中华民国」申请过，自然有美国申请档案档案存在台北。
延续：美国后来没有声明抛弃该主权承认，那麽就构成延续，就构成了长期承认。驻菲美军70年代初把黄岩岛作为训练靶场（很可能有过申请及蒋介石政府的批準，相关资料需要大陆官方去台湾省查）只是使用而非夺得主权。
台湾省曾主辖黄岩岛
依据“美国承认黄岩岛是中国领土” 文章介绍的情况看：台湾省当局（或中华民国残余政权）曾管理黄岩岛，它是向美国海军人员颁发许可证的管理者。当时，美国与中国的建交还是与残余的中华民国（美国与中国大陆建交是尼克松访华之后的事了），这就是现代中国管理黄岩岛的一个重大事实。
这种主权，无论台湾省当局还是中国大陆都没有放弃过，由于中国大陆在联合国取代了蒋介石政权的代表权，因此，黄岩岛的国际关系上的主权转移到了中国大陆。而且，在国际事务领域中国大陆后来继续行使该主权，从20世纪70年代起，中国大陆政府受理并批準了多次国际无线电爱好者要求登岛探险的申请。
其它论证
中国社会科学网刘惠恕《黄岩岛属于中国的历史依据》 从多个方面，论证了中国主权及其力量形成，很长，文献资料很详细，很多内容是一般人不了解的。
该文目录如此：一、历史上中国最早发现黄岩岛并将其标入国家地图。二、历史上的菲律宾群岛从来不是一个统一的国家，在菲律宾群岛上出现的诸多国家，都曾是中国的属国，中国政府享有对南海的宗主权，因此，中国与菲律宾的海疆分界，只能是在南中国海与苏禄海之间。例如，明永乐三年（1405年），钦差大臣三保太监郑和下西洋，巡莅菲律宾群岛，奉永乐帝诏书封许柴佬为吕宋总督，统揽该国军、政、财、文大权。任职直到永乐二十二年（1424年），达20年之久。三、近代西方殖民者对菲律宾群岛上原有国家的征服，即中国政府丧失宗主权的过程，中国政府从未承认，近代菲律宾的独立，是向美国人乞求的结果，菲律宾在独立时，也同时继承了近代西方殖民者对菲律宾群岛南部原中国属国未竟的征服事业，如果菲政府有权向中国政府提出黄岩岛的主权要求，中国政府也同样有权向菲政府提出有关苏禄国旧地与古麻剌朗（马巾达瑙苏丹王国）旧地（棉兰老岛）的主权要求。四、历史上美军曾佔领过黄岩岛为靶场，但这不足以成为菲律宾向中国提出黄岩岛主权要求的理由，同样，联合国所颁发的二百裏海洋法及菲政府提出的其他理由都不足以成为菲律宾向中国提出黄岩岛主权要求的理由。（所谓“美军曾佔领过黄岩岛为靶场” 是因为作者没看过萧曦清的着作，不了解美军向蒋介石方面的申请和批準的资料）
走向争端
曾无抗告
20世纪90年代以前，国际社会对中国拥有黄岩岛主权从未提出任何抗告，不存在对该岛的主权之争。
1898年《美西巴黎条约》、1900年《美西华盛顿条约》和1930年《英美条约》等明确规定了菲领土界限西限以东经118度为界，黄岩岛在此範围之外。1935年菲宪法、1947年美菲一般关系条约、1952年菲美军事同盟条约、1961年6月17日菲关于领海基线第3046号法令和1968年菲关于领海基线的修正令等都先后重申了三个条约的法律效力，再次明文确定了菲领土範围，菲领海基点和基线均未包括黄岩岛。1981年、1984年菲出版的地图也都将黄岩岛标绘在菲领土界限之外。
1946年初，菲律宾财长季裏诺向总统罗哈斯建议佔领南沙群岛中部分岛屿。同年9月11日，季裏诺又以外长身份致函时任盟军总司令的麦克阿瑟，提出由菲律宾兼并南沙群岛的要求，但被美国否决。
1948年9月，季裏诺成为菲律宾总统，他下令国防部长派遣海军準将安德拉达赴太平岛及其附近区域视察。而部分内阁成员也附和季裏诺，建议将南沙群岛归并菲律宾版图。当时中华人民共和国与菲律宾还没有建交，但中国外交部于1956年5月29日发表严正声明：“南海上的太平岛和南威岛，以及它们附近的一些小岛，统称南沙群岛。这些岛屿向来是中国领土的一部分。中华人民共和国对这些岛屿具有无可争辩的合法主权。”此后，中国政府多次发表声明，重申中国对包括西沙群岛、南沙群岛在内的南海诸岛享有合法主权，绝不容许任何国家以任何借口和任何方式加以侵犯。
1978年菲方造事
菲律宾经过在南沙侵佔一个个岛礁（西月岛、中业岛、北子岛等等）的过程之后，在1978年6月，菲律宾政府以总统法令的形式，将我南沙群岛的大部分岛礁划入其版图，霸佔了我南沙大半海域。同时又以专属经济区的名义，将黄岩岛及其附近海域，也囊括其中。这样，菲律宾已将我42万平方公裏的海域非法划入其版图。
1992年起菲方再挑事
1992年，菲律宾前国家安全顾问戈勒斯声称黄岩岛是菲律宾国土，挑起争端。从1993年起，菲律宾对该岛进行勘测、考察和巡逻。50年代初，驻菲苏比克湾的美国军队无视中国主权，擅自将黄岩岛开闢成为靶场（说明：有的说是70年代初，其实应该是70年代的事，因为美军调查黄岩岛是1957-1958年；可能得到过台湾省当局批準，或后来改正了，所以1957年美国海军欲在黄岩岛调查、曾向残余的中华民国政府申请并得到批準）。1977年10月、1978年6月，中国科学院南海海洋研究所的科研队还登上岛进行考察活动。
1997年开始，菲方多次出动军舰和军用飞机在黄岩岛及其附近海域对民间组织的无线电探险活动进行跟蹤、监视和干扰。4月30日，菲国两位众议员公然搭乘海军舰艇登上黄岩岛，他们在岛上竖旗立碑，并对中方人员进行拦堵和恫吓。1980年后，菲律宾政府将黄岩岛划在其200海裏专属经济区内，但由于当时黄岩岛由驻菲美军实际控製，菲律宾并未提出主权要求。
1994年10月18日菲国家地图和资源信息部及1994年11月18日菲业余无线电协会向美国业余无线电协会出具的档案中，均确认“菲领土边界和主权是由1898年12月10日巴黎条约第三款所规定，黄岩岛位于菲领土边界之外”。
1994年《联合国海洋法公约》有关专属经济区的法规颁布实施后，菲律宾政府以黄岩岛位于其200海裏专属经济区内为理由，宣称对黄岩岛拥有海洋管辖权，后来又改为对黄岩岛拥有主权。
1997年，菲律宾海军毁坏了中国主权标志。1997年4月30日，中国无线电运动协会组织的中美日无线电探险队登上黄岩岛进行无线电探险活动期间菲律宾多次出动军舰和军用飞机对此进行跟蹤、监视和干扰。1997年5月20日，一艘菲律宾海军巡逻艇在黄岩岛外11千米处拘捕了一艘準备航行到马绍尔群岛的中国渔船，拘留了21位中国渔民。1997年8月5日，菲律宾和美国联合在黄岩岛附近举行飞机和战舰的实战演习。
1998年1—3月，来自海南省琼海市潭门镇的琼海00473和00372号以及中远渔313和311号四艘渔船在两个月时间内，相继在黄岩岛海域被菲海军拦截，51位渔民同样遭到“非法入境”的指控，被菲拘押近半年时间。
1999年5月23日，中国一艘渔船在黄岩岛遭菲军舰追击并被撞沉，导致11名渔民落水。据报道，菲海军在追赶渔船时，曾使用机枪扫射。中国外交部发言人就此向菲提出严正抗议和交涉。1999年6月，菲律宾教育部在新版地图中将黄岩岛，连同整个南沙群岛列入版图。8月，菲政府把“南沙群岛是菲律宾领土”列为修宪的内容，尝试以法律的形式进行领土扩张。
2000年1月6日，菲海军又在黄岩岛公然驱逐中国正常作业的六艘渔船。1997年以来，菲海军在黄岩岛抓捕好几批中国渔民，都以“非法入境”、“非法捕捞”等莫须有的罪名将他们移交司法机关处理。 2000年5月28日，菲海军开枪射杀一名中国渔船船长。
2001年5月底、6月初，中国大陆在西沙群岛进行军事演习，禁止船只进入西沙附近海域。越南就此演习表示抗议，并重申其对南海西沙与南沙群岛之主权。2001年9月，《詹氏国防周刊》报道中国大陆新增20至24艘海军巡逻舰只，主要负责执行包括南沙群岛附近海域的巡护任务。为了避免引起扩充南海军事存在的指控，这批新增造的巡逻船将交由海关部门使用，但船上人员系属人民解放军海军的官兵。
2009年1月28日，菲律宾参议院三读（即最后一读）通过了2699号法案，即“製定菲律宾领海基线的法案”，该法案将中国所有的两处岛屿划为菲律宾所属岛屿。2009年2月18日，中华人民共和国外交部就菲律宾国会通过“领海基线法案”发表声明。国防部新闻发言人耿雁生就中国海军针对南海问题的态度作出了回应称中国军队将密切配合渔政、海监等部门共同维护国家的海洋权益。
2009年3月10日菲律宾总统阿罗约不顾中国的反对，正式签署“领海基线法”，将中国的南沙部分岛礁和黄岩岛划入菲领土。中国驻菲律宾大使馆11日对此表示强烈反对和严正抗议。接下来，这一法案将被提交联合国审议。
2012年4月10日菲律宾海军巴拉望号在海南省三沙市黄岩岛海域抓捕12艘中国渔船上的中国渔民，正当菲律宾海军在中国渔船上抓捕渔民时，中国海监船75号和海监船84号抵达，阻止菲律宾海军带走中国渔民和渔船，随后中国渔政船和菲律宾海军护卫舰开始对峙。
菲律宾声称，早在菲律宾的西班牙殖民初期，菲律宾渔民就已将帕纳塔格礁（黄岩岛）作为传统的渔场和躲避海上恶劣气候的避风港【1565年菲律宾宿雾岛为来自墨西哥的西班牙人所佔领，此即西班牙统治菲律宾的开始。1898年爆发美西战争，成立菲律宾共和国。尔后西班牙战败，签署“巴黎和约”，美国接收菲律宾，改由美国统治】。1957年，菲律宾政府和一起美国海军对该地区的海洋进行了调查，当时该地区实际受美国海军基地苏比克湾的控製。1965年，菲律宾在帕纳塔格礁（黄岩岛）上树立了一个8.3米高的旗桿悬挂菲律宾国旗。同一年在该地建成了一个小灯塔。1992年，菲律宾海军将该灯塔报告给国际海运组织。截至2009年，这个军事维护灯塔都是非经营性的。
注意事项
中菲两国在岛上都没有永久设施或主权标志。中国主权标志于1997年被菲军非法破坏。到2008年以前，黄岩岛地区还是被菲律宾海军非法控製。旅游潜水（1998）和业余无线电探险（1994，1995，1997 和2007）也是允许的，但会受到菲律宾海军的非法监视。
黄岩岛对峙事件
详细内容见词条：黄岩岛事件。凤凰网专题内容见：“中菲黄岩岛对峙专题_资讯频道_凤凰网” 。
2012年4月10日，菲律宾海军闯入中国三沙市黄岩岛海域，打着“维护主权”的旗号对避风停靠在该海域的12艘中国渔船进行袭扰，并企图派携带武器的海军人员登上中国渔船抓捕渔民。“中国海监75号”和“中国海监84号”渔政船事发后赶至黄岩岛海域，菲抓捕中国渔民的企图未能得逞。
2012年4月12日，菲律宾不顾中方严正交涉与警告，再向黄岩岛海域派遣一艘海岸警卫队船只，中菲双方的对峙仍在继续。例行记者会上外交部发言人刘为民证实，派出的是政府公务船而非军舰，并表示中菲双方正通过外交渠道就此保持着沟通。中方向黄岩岛海域派出了第三艘船只。
2012年4月17日，菲律宾海岸警卫队的埃德萨号抵达南海黄岩岛水域，替换了对峙的巴拉望号，菲方停留在黄岩岛海域的各类船只仍有20余艘。菲律宾外交部发言人的话称，菲律宾护卫舰埃德萨斯号进入了黄岩岛海域，政府要求其必须升起白旗，以表示和平解决此次对峙的意愿。
中船离开
2012年4月18日，中国最先进的渔政船——中国渔政310船从广州出发，开赴南海海域，开展常态化的渔政巡航执法管理。该船19日进入中沙群岛海域，20日中午到达黄岩岛海域。菲律宾搜救船“BRP-埃德萨”号和中国的一艘海监船在黄岩岛周边海域仍处于一对一的对峙状态。
2012年4月23日，中国驻菲律宾大使馆发言人张华透露，中国渔政310船和中国海监84船已在22日下午离开黄岩岛海域，只有一艘中国海监船留在黄岩岛海域执行执法任务。中方愿通过友好外交磋商解决黄岩岛事件。
菲拒撤离
2012年4月23日，黄岩岛海域有4艘中国船只与1艘菲律宾海岸警卫队船只对峙。菲外长德尔罗萨裏奥宣称，菲方不会把海岸警卫队船只从黄岩岛撤回，“当我们愿意离开时才离开，不是被人要求离开就离开”。菲国防部长加斯明更是公开对菲外交部下起“指导棋”，他认为中国渔政310船进入黄岩岛水域是入侵，“外交部应立即向中方提交抗议，予以谴责”。菲总统阿基诺也声称，菲律宾会继续在黄岩岛部署船只，因为“相信那是菲律宾水域”，但同时表示，菲律宾政府会持续与中方官员对话，寻求解决海上对峙事件。
从2012年5月16日12时起，中国南海大部分海域将进入为期两个半月的伏季休渔期。届时，在北纬12度以北至“闽粤海域交界线”的南海海域（含北部湾），除单层刺网、钓业外，禁止其他所有作业类型生产。中国农业部南海区渔政局负责人同时表示，由于黄岩岛海域位于中沙群岛海域，位于北纬15度以北，属于此次休渔製度的控製範围。中国此次实行的休渔与当前的黄岩岛事件无关。
菲方发布的“休渔令”已于2012年5月16日起生效，从当天起禁止菲律宾渔民到黄岩岛捕鱼两个月。这项禁令是为便于该机构渔业专家对黄岩岛开展研究，以决定实施保护的方法。菲渔业和水产资源局局长佩雷斯称，为期两个月的“休渔令”可能会延长，但“这要取决于研究的结果如何”。
2012年6月6日，中国已开始在黄岩岛进行工程建设，建筑工程将在数周内完工。通过卫星照片可以判断中国已长期在黄岩岛海域停留，运送建筑材料的船只正在向黄岩岛不断卸载碎石、石材、水泥和金属；数艘中国海监船也在附近巡逻，阻止菲方接近。几周内“中国国旗就将飘扬在黄岩岛上”。
2012年9月13日，黄岩岛海域潟湖入口仍被中国用绳索封锁，3艘中国船只守卫着该海域，阻止菲律宾渔船进入。
2014年1月27日，中国海警在黄岩岛“用水炮”驱逐菲律宾渔船。2014年2月25日，菲律宾发表外交抗议中国政府船只在南海争议岛礁“使用水炮”驱赶菲律宾渔民一事。中国大使馆官员没有立即对菲律宾的抗议作出回应。
2014年2月25日下午，菲律宾军方发言人宣布，菲军已把斯卡伯勒浅滩（即中国黄岩岛）置于西部军区管辖下。与此同时，菲律宾声称将对中国进行军事回应。
2016年《菲律宾星报》5月31日报道，菲律宾总统阿基诺对记者表示，当年与中国在黄岩岛对峙，最终撤离的原因是美国调停介入；美方的态度意在降低沖突，挽留双方颜面。
国际法庭裁判事件
2012年4月底菲律宾提出要把黄岩岛问题提交“国际法庭”解决，旨在将黄岩岛问题国际化。2013年1月22日，菲律宾正式向联合国海洋法法庭提请针对中国的仲裁。对此，中国外交部多次发表声明，指出“菲律宾和仲裁庭无视仲裁案的实质是领土主权和海洋划界及其相关问题，恶意规避中国于2006年根据《联合国海洋法公约》第298条有关规定作出的排除性声明”，强调中方“不承认、不参与”。 外交部说明菲律宾是以包装混淆手法曲解《联合国海洋公约》 。
《联合国海洋公约》规定海洋主权仲裁需双方同意；而且中国和澳大利亚等30多国在2006年按规定提交了正式声明（一直公布在联合国海洋与海洋法司的网站），说明凡海洋主权问题只有在争议双方都同意由国际海洋法庭进行仲裁，仲裁才能进行。当时的声明属于公约体系 ，因此菲方诉讼案实际上违法、该仲裁庭的出现实际上违法、而且违反了该仲裁庭两个成员以前在相关着作裏一直坚持的立场 。
岛礁历史
简述
黄岩岛自古就是中国固有领土，神圣不可侵犯。中国最早发现了黄岩岛。1279年，元世祖忽必烈派天文学家郭守敬进行“四海测验”。“四海测验”时在南海的测量点就是黄岩岛。中国历代政府出版的官方地图均将黄岩岛标为中国领土。黄岩岛一直不间断地在中国广东省、海南省的管辖下。中国政府关于南海诸岛主权公告和声明中均指出黄岩岛领土主权属于中国。
黄岩岛海域是中国海南、广东等地渔民的传统渔场。《载敬堂集·江南靖士诗稿·黄岩岛》诗“驾我万裏舟，渔我黄岩岛。郭公绘海图，千年在版早” ，真切地反映了中国版辖、经营黄岩岛及渔民在黄岩岛从事渔业生产的历史。根据联合国的国际海事公约，无论涨潮落潮都是干地者为岛，否则为礁。中国人自古称之为黄岩岛，而美国人叫“Scarborugh Shoal”，其它西方人叫“Scarborough”，翻译过来都是“斯卡巴洛礁（Scarborough Reef）”，中国在四十年代也曾一度改称为“民主礁”。
现代
1935年1月，中国水陆地图审查委员会将黄岩岛(时称“斯卡巴洛礁”），是南沙群岛的一部分)列入中国版图。1947年10月，国民政府核定和公布的南海诸岛新旧名称对照表中，将斯卡巴罗礁改成为民主礁，列在中沙群岛範围内。1956年至1958年，美国在向台湾省当局申请并经批準后，派海军人员到黄岩岛进行地质勘察。
1947年底，中国内政部正式编製出版的《南海诸岛位置图》将民主礁（黄岩岛）划在“断续国界线”内。该线是具有法律效力的历史性界线，中国对线内的岛、礁、滩、沙洲拥有主权。
1983年，中国地名委员会受权公布的《中国南海诸岛部分标準地名》将黄岩岛定为标準名称。
1992年以来，菲律宾前国家安全顾问戈勒斯声称黄岩岛是菲律宾国土，挑起争端。
1997年爆发亚洲金融风暴，东南亚国家面临严重经济危机，为转移国内矛盾压力，趁中国未对该区域进行强力管辖，开始大肆霸佔南沙岛礁，菲律宾尤为积极，其海军毁坏了中国主权标志；当一艘载着中、美、日三国无线电爱好者的中国船只抵该岛考察时，菲律宾在外交场合竟然称中国“企图佔领黄岩岛”，还製定了作战原则以维护其“主权”。1998年，菲律宾成立了包括舰艇部队、航空分遣队和情报部队的专门机构。1997年，菲律宾海军故意炸毁中国南海黄岩岛上的中国主权标志。
1999年，菲军舰多次驱赶、撞沉中国渔船。并特意将淘汰的军舰“BRP Benquet ”搁浅在黄岩岛(11月3日)上。中国要求菲律宾拖走。作为总理朱镕基正式访问菲律宾的前提，12月5日“BRP Benquet”被拖离了黄岩岛。(2004年菲律宾又将它放到南沙中业岛上了 )
2009年1月28日下午，菲律宾参议院三读通过了2699号法案，即“製定菲律宾领海基线的法案”，该法案将中国所有的南沙群岛和黄岩岛2处岛屿划为菲律宾所属。仅仅几天后，2月3日，菲律宾众议院通过3216号法案，即“菲律宾群岛领海基线确定案”，将上述两处岛屿划入菲律宾领海基线，引起国际舆论一片哗然。
2012年设立三沙市后，黄岩岛归三沙市管辖。2012年5月，世界纪录协会发布了两项与黄岩岛有关的世界纪录：中国人是世界最早发现黄岩岛的人；中国政府是世界最早对黄岩岛进行地理测量的政府；这两项世界纪录清楚地表明黄岩岛属于中国。
2012年4月10日，中国与菲律宾爆发事件，5月9日，中国获得黄岩岛实际控製。
2014年4月9日，美国与菲律宾在离黄岩岛220公裏处军演，向我国展示武力，企图恫吓我国。
2015年4月20日，美国与菲律宾再次在离黄岩岛220公裏处“肩并肩”军演，人数过万。其中菲方出动5023人、15架战机、1艘军舰参演。美方则出动6656人、76架军机和3艘军舰参演。 6月8日，日本NHK电视台报道，日本海上自卫队将于本月下旬向菲律宾派遣巡逻机，并且计画与菲律宾海军在南海首次举行正式的联合训练。
2015年4月21日，菲律宾渔船借美菲军演之机再次入侵我黄岩岛海域，菲方则称中国海警在黄岩岛用水炮驱赶菲渔船，损毁了其中部分木船，向我国提出抗议。 22日，美国国务院发言人玛丽·哈夫认为中国海警在南中国海的有争议海域对长期从事捕鱼活动的菲律宾民用船只使用水炮将构成一种挑衅行为。 24日，中国外交部敦促菲方杜绝在黄岩岛海域从事非法活动，加强对本国渔民的管束和教育，杜绝在黄岩岛海域从事非法活动。
2015年7月，菲律宾有人在网上提出，要求谷歌移除其地图服务上中文标注的“黄岩岛”，数日之后，开启谷歌地图就已找不到“黄岩岛”三个中文字。谷歌对此修改并未做出公开表态。
